Pour tester l'effet de l'antibiotique sur l'évolution des populations bactériennes, nous allons réaliser une modélisation. Dans le modèle, il y a 3 agents :
bactéries S (sensibles à l'antibiotique)
bactéries R (résistantes à l'antibiotique)
L'antibiotique est administré pendant les 1100 premiers tours de la modélisation.
Des règles pour chaque agent sont enregistrées dans le modèle :
Mutation : des bactéries sensible peuvent se transformer en bactérie résistante par mutation (événement très rare)
Transfert horizontal de gène : une bactérie peut transférer à une autre bactérie des gènes. Cela peut transformer une bactérie sensible en bactérie résistante (événement rare)
Multiplication : les bactéries se multiplient par mitose. Une bactérie résistante donne 2 bactéries résistantes. Une bactérie sensible donne 2 bactéries sensibles.
Action de l'antibiotique : celui-ci élimine les bactéries sensibles
Protocole
Partie 1
Accéder au modèle en cliquant : Edu'modèles
Télécharger le modèle étusié en cliquant : Modèle antibioresistance
Cliquer : "Charger un modèle"
Indiquer le nombre de tours : 3000
Démarrer la modélisation
Réaliser une capture d'écran du graphique obtenu
Télécharger en cliquant sur "Exporter" dans la partie "Graphique". Vous obtiendrez un fichier.csv
Recommencer en retirant l'antibiotique dans "Agent"
sélectionner un agent et supprimer le
démarrer une nouvelle modélisation
Partie 2
Ouvrir votre fichier .csv dans un tableur
Créer une colonne qui donne le pourcentage de bactérie résistantes pour chaque tour
=(quantité de bactéries R / quantité de bactéries S) * 100
Construire un graphique qui montre le pourcentage de bactéries résistantes en fonction du nombre de tours