Séquencer l'adn

Le génome humain (ensemble des gènes d'un individu) a été séquencé en 2004 après 15 années d’une collaboration internationale. Aujourd'hui, on séquence un génome humain en quelques heures. 

Chaque cellule humaine comporte un génome de 3 milliards de nucléotides répartis dans 46 chromosomes. On a déterminé que le génome humain contient 21000 gènes environ et on en a réalisé une cartographie sur les différents chromosomes. Ces gènes occupent 1,5% de l’ADN. 

Chaque individu est génétiquement unique par sa combinaison d’allèles qui théoriquement est propre à chacun. 

La diversité génétique intraspécifique est faible chez l’humain puisque 99,6 % de nos génomes sont identiques, mais 0,4 % de différences représentent tout de même plusieurs millions de nucléotides ! Cette caractéristique du génome permet d’identifier chaque individu par certains de ses allèles. Cela est exploité dans le cas de recherche de parenté ou d’enquêtes criminelles.

Le séquençage aujourd'hui

Le séquençage est une technique lourde est coûteuse mais qui a beaucoup évolué depuis Sanger. Aujourd’hui, le séquençage est automatisé et son coût a pu être réduit. Toutefois, l’acquisition d’un séquenceur coûte cher et nécessite le regroupement de plusieurs laboratoires en Centre de recherche. Le séquençage automatique utilise des didésoxynucléotides couplés à des fluorochromes. La synthèse a lieu en présence des 4 nucléotides normaux et des 4 ddNTPs marqués. Les fragments obtenus sont ensuite séparés par chromatographie. À la sortie de la colonne de chromatographie, un lecteur détecte la nature de la fluorescence et la taille du fragment. Le résultat est obtenu sous la forme de graphiques dont chaque pic correspond à un nucléotide. La lecture de la séquence est donc plus rapide. De plus, cette méthode permet le séquençage de fragments plus longs.

Exemple de résultat de séquençage